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锐谈 | NC:一个可自动调节控制拷贝数的质粒

锐谈 | NC:一个可自动调节控制拷贝数的质粒

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  • 作者:M
  • 来源:
  • 发布时间:2023-02-03 09:19
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锐谈 | NC:一个可自动调节控制拷贝数的质粒

【概要描述】 外部控制基因表达的才干改动了所有生物考究领域的范式,是合成生物学。这种控制发作在转录和翻译水平上,而能够在DNA拷贝水平进步行控制的技术受到以下限制:

1)依赖于少数具有固定和任意拷贝数的质粒;

2)需要多个质粒进行复制控制;

3)仅限于特殊菌株。



征服这些限制,研究者提出了TULIP: 一种具有可诱导拷贝数控制功能的独立质粒,目的是在千般常用于克隆、卵白质表达和代谢工程的大肠杆菌菌株之间兑现可移植。

这项查究成效“Inducible plasmid copy number control for synthetic biology in commonly used E. coli strains”发表2,02211月的子刊 Nature communications。


验证使用PCN控制基因表达的潜力,设计了一个可主动调节控制的质粒。




RepAv7和可诱导的CymRAM按捺性TF被置于PCymRC启动子下的多克隆配置中,PCN被单体步地的RepAv7上调。而通过二聚体步地的负反馈被有效消除。

相反,PCN的下调现在是通过CymRAM实现的。

这种效应可以通过Cuminic acid调节:插足Cuminic acid后,CymRAM对RepAv7的按捺被解除,爆发前者的更大表达,导致质粒复制补充。RepAv7的正效应被CymRAM对RepAv7表达的负效应所均衡,来到了均衡。



查究者在四种常用的大肠杆菌菌株,包括质粒克隆、卵白质表达、代谢工程和微生物学模子菌株,以及NEBSable,结果验证了TULIP不妨胜利的在广泛的大肠杆菌菌株中进行灵活的PCN控制。





研究者通过TULIP裁汰对克隆和转化的依赖性、TULIP可在差异背景下频频使用模块等多个应用实例证明TULIP不妨实现动态的PCN控制,不单可以加速基因电路的设计和优化,可以促进模块在差异遗传背景下的菌株进行设计和使用。



原文出处:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9637173/

作者:M

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  • 发布时间:2023-02-03 09:19
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外部控制基因表达的才干改动了所有生物考究领域的范式,是合成生物学。这种控制发作在转录和翻译水平上,而能够在DNA拷贝水平进步行控制的技术受到以下限制:
1)依赖于少数具有固定和任意拷贝数的质粒;
2)需要多个质粒进行复制控制;
3)仅限于特殊菌株。
为了克服这些限制,研究者提出了TULIP(TUnable Ligand Inducible Plasmid):一种具有可诱导拷贝数控制功能的独立质粒,目的是在各种常用于克隆、蛋白质表达和代谢工程的大肠杆菌菌株之间实现可移植。
这项查究成效“Inducible plasmid copy number control for synthetic biology in commonly used E. coli strains”发表2,02211月的子刊 Nature communications。

为了验证利用PCN来控制基因表达的潜力(图1),设计了一个可自动调节控制的质粒

RepAv7和可诱导的CymRAM按捺性TF被置于PCymRC启动子下的多克隆配置中,PCN被单体步地的RepAv7上调。而通过二聚体步地的负反馈被有效消除。
相反,PCN的下调现在是通过CymRAM实现的。
这种效应可以通过Cuminic acid调节:插足Cuminic acid后,CymRAM对RepAv7的按捺被解除,爆发前者的更大表达,导致质粒复制补充。RepAv7的正效应被CymRAM对RepAv7表达的负效应所均衡,来到了均衡。

查究者在四种常用的大肠杆菌菌株,包括质粒克隆、卵白质表达、代谢工程和微生物学模子菌株,以及NEBSable,结果验证了TULIP不妨胜利的在广泛的大肠杆菌菌株中进行灵活的PCN控制。

研究者通过TULIP减少对克隆和转化的依赖性(图3)、TULIP可在不同背景下重复使用模块(图4)等多个应用实例说明TULIP能够实现动态的PCN控制,不仅可以加速基因电路的设计和优化,还可以促进模块在不同遗传背景下的 菌株进行 设计和使用

原文来源:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9637173/

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