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锐谈 「 Nat. Commun:代谢工程酿酒酵母再行生物合成甜菊苷和莱鲍迪苷

锐谈 「 Nat. Commun:代谢工程酿酒酵母再行生物合成甜菊苷和莱鲍迪苷

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  • 发布时间:2023-06-26 15:44
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锐谈 「 Nat. Commun:代谢工程酿酒酵母再行生物合成甜菊苷和莱鲍迪苷

【概要描述】

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江南大学刘龙老师团队以酿酒酵母为底盘菌株从头合成代糖甜茶苷和莱鲍迪苷,最终在15L发酵罐中从头合成1368.6 mg/L和132.7 mg/L的甜茶苷和莱鲍迪苷。

首先分为5个模块构建甜茶苷的生物合成途径,分别是:

①萜烯合成模块:引入Gibberella fujikuroi来源的 kaurene synthase「KS」、过表达MVA pathway的关节酶tHMG1和IDI1、引入法尼基焦磷酸合成酶的突变体FPSF112A,以裁汰对FPP的消耗,而FPP可用于合成其他对细胞成长所得物质;

②P450s模块:引入Stevia rebaudiana来源的KO以及一种细胞色素P450s还原酶CPR1和Arabidopsis thaliana来源的KAH;

③甜茶苷合成模块:引入S. rebaudiana来由的两种UDP糖基转移酶UGT74G1和UGT85C2;

④UDP-葡萄糖合成模块;

⑤甜茶苷输出模块:经液相检测和质谱分析确定,工程菌株SGN06发作了4.5 mg/L的甜茶苷。

接着,找到限速步骤并消除:

①过表达P450s模块中的三种酶,发现过表达KO使得甜菊醇steviol的产量提高91.3%;

②发觉KAH和CPR1含有跨膜结构域,当截短CPR1的TMD使得steviol滴度添补231.2%,而当截短KAH的TMD无法合成steviol;

③为优化底物运输通过短卵白接头融合表达这些酶,融合表达KAH-GGGGS3-trCPR1使得steviol产量最高达40.6 mg/L,此时UGT模块基因整并拢去得到32.2 mg/L的甜菊苷,是初始菌株的7.2倍;

④为平衡内质网卵白合成负荷及其折叠才能,用强的启动子取代其内源性启动子来过表达ER巨细调节因子INO2,甜菊苷滴度补充至67.7 mg/L。

之后,提高酵母宿主对甜菊苷的耐受能力:
①因为在胞外检测到产品,猜测酵母质膜中没关系存在主动外排系统输出甜菊苷,通过将产品与Alpha Fold Protein Structure Database  「https://alphafold.ebi.ac.uk/」 数据库的转运卵白对接发觉与ABC转运卵白的亲和力最高,通过质粒过表达外排泵,发觉过表达PDR11使甜菊苷的产量添加129.8%达155.6 mg/L;
②细胞应激反映调节不妨触发运送机制,并补充对真菌苛刻发酵前提的适应。在对六种差异的应激反映因子的查究中发觉,MSN4的转录水平随着甜菊苷含量的补充而升高。当MSN4在菌株SGN08中运用质粒pY16-TEF1p过表达时,甜菊苷滴度补充了2倍,抵达205.5 mg/L
但两种策略共同使用不能使产量更高,需要提高代谢通路流量。
结尾,通过基因组规模的代谢模子对工程对象进行计算机预测:通过计算机模拟解析敲除五个靶标,当GAL7被敲除时,甜菊苷滴度添补了19.4%达247.2 mg/L,阻断GAL7可能有利于葡萄糖-1-磷酸转化为UDP葡萄糖,这表明UDP葡萄糖浓度可能是SGN13中甜菊苷爆发的限速因素,在敲除GAL7的菌株中过表达PGM2使甜菊苷滴度提高到302.1 mg/L
在15-L生物响应器中补料分零售酵中呈现最佳的菌株甜菊苷滴度达到1368.6 mg/L,这是迄今为止达到的最高滴度。
本考究格外详尽的描画了构建工程菌株的基本思路和细致的策略,为我们设计和改造其他天然产品的生物合成门路提供了参考,对于限速步骤的辨别并如何排除格外规范,要更多的融合计算机模拟等方式,为更多高附加值产品的合成助力。

原文链接:https://www.nature.com/articles/s41467-022-30826-2

作者:巴图鲁

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