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锐谈「 Nat. Commun：利用合成sRNA 在万般细菌中进行靶向和高通量基因敲低

分类：新闻动态
作者：Chow
来源：
发布时间：2023-09-08 15:34
访问量：

锐谈「 Nat. Commun：利用合成sRNA 在万般细菌中进行靶向和高通量基因敲低

【概要描述】

分类：新闻动态
作者：Chow
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发布时间：2023-09-08 15:34
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财产生物技术应用中，高效的微生物细胞工场依赖于微调代谢和调控网络运用可更生资源生产多样化学品，但通过染色体操为难潜在基因靶标的鉴定和试验验证是费时费劲。比方CRISPRi等反式作用的靶基因敲低编制，没关系在转录程度上敲低靶基因，而无需染色体独霸，近来的Mobile-CRISPRi编制可用于敲低差异细菌中的靶基因。然而，由于Cas9蛋白引起的代谢负荷，基于CRISPR的工具在细菌中的现实应用偶尔受到限制。

比来，韩国国度科学与工程院院士Sang Yup Lee和他的团队在Nature Communications 通信上发表了题为“Targeted and high-throughput gene knockdown in diverse bacteria using synthetic sRNAs”的查究，汇报了一种合用于多种细菌的sRNA平台的开垦，该平台由sRNA支架和来自枯草芽孢杆菌的Hfq蛋白构成，其多功能性可算作多种细菌中的基因敲低工具。算作该sRNA系统的代谢工程应用，通过靶基因的组合敲低，开垦了不妨发作戊内酰胺和邻氨基苯甲酸甲酯的高性能谷氨酸棒状杆菌菌株；构建了围困2959 C. glutamicum基因组尺度的sRNA文库，用于高产靛蓝菌株的高通量比色筛选，获得了迄今为止不妨生产最高滴度靛蓝的菌株。

利用枯草芽孢杆菌的RoxS和Hfq组成的BHR-sRNA体系，能够便利有效的敲低一十六种差异细菌物种的基因，包含致病菌、共生菌、益生菌或财产菌株，说明了这种sRNA技术的广泛适用性；该体系可用于鉴别基因敲低靶标，以增深化学品的生产。本考究说明，BHR-sRNA平台是一种普遍适用的合成生物学和代谢工程工具包，能够兑现、高效、准确和高通量的敲低差异细菌中的基因靶标。