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锐谈 「 Metab. Eng.:IPP旁路甲戊酸路线出产异戊烯醇的高通量酶筛选平台

锐谈 「 Metab. Eng.:IPP旁路甲戊酸路线出产异戊烯醇的高通量酶筛选平台

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  • 发布时间:2023-12-01 13:49
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锐谈 「 Metab. Eng.:IPP旁路甲戊酸路线出产异戊烯醇的高通量酶筛选平台

【概要描述】

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异戊烯醇是生物燃料中的一种,异戊二烯等商品化学品的前体。

此刻已知在大肠杆菌中通过甲羟戊酸道路道路生产异戊烯醇,产量为理论最大值的70%。

本文基于甲羟戊酸二磷酸脱羧酶的混同活性斥地基于IPP旁路的异戊烯醇路线。

一.MVA途径及不足

一分子MVA由两步磷酸化转变为一分子MVAPP,消耗两分子ATP,颠末脱羧酶PMD生成一分子IPP,消耗一分子ATP,图。

综上通过MVA途径生产一分子IPP必要消耗三分子ATP,同时IPP水解时磷酸基团会被白费,同时IPP积累会按捺大肠杆菌发展。

MVA途径因为异戊烯基二磷酸的毒性,及ATP的高需求量,提高产率。

二.IPP旁路途径

文章改进:本文改用甲羟戊酸二磷酸脱羧酶(PMD)的混杂活性开发基于IPP旁路的异戊烯醇途径。

采用异源表达酿酒酵母PMD酶脱羧MVAP变成磷酸异戊烯基(IP」,此道路可以降低IPP毒性,并降低ATP的消耗,图「B」。

同时PMDsc对非天然底物MVAP的活性低,是以需构建PMD的突变菌株,提高活性。
三.构建筛选平台

将宿主菌株生长速率与PMD酶脱羧速率耦合,筛选PMD突变体。

方案:

1. 在栽植基中补充MEP途径按捺剂Fosmidomycin,按捺MEP途径,阻断发作IPP和MAPP的独一途径,图「B」。

2. PMDsc的混同酶活性,与IPP、二甲基焦磷酸烯丙酯DMAPP的形成相耦合。

3. 增补抑制MEP途径的抗生素排除内源性MEP途径爆发的IPP,只有异源IPP旁路的表达大肠杆菌本事滋长。

步骤1:

对比报道中三种对IP有活性的激酶EcIPK、MtIPK、TaIPK在DH1菌株野生型中表达,对比得出MtIPK活性最高。

结论:优化了大肠杆菌DH1只能从由MVA路线旁路路线中爆发的IPP中存活,验证了细胞生长依赖于异源表达的IPP旁路中MVAP的脱羧反响。
(图a)
步骤2:

三种PMDsc突变体的动力学测定,R74H突变体活性最佳,同时成长速率。

结论:发展速率依据MVAP脱羧活性和PMDsc的表达程度而变化。
(图b)

四.筛选平台的应用

构建好全体筛选平台的底层菌株后,对PMDsc构建酶文库,验证多种差别的PMDsc突变体在构建好的筛选平台条件下酶活性、菌株滋长速度与产物滴度具有一定的相干性,「表2」。
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.ymben.2017.03.010

作者:祭

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